Overnight Medical LLM Dataset Mining

通宵公共医学数据集目录:唯一条目 4629

目录更新至 2026-10-18 16:55 Asia/Shanghai · 夜班 0:00–8:00 通宵挖掘后,Round-88 继续加深(GitHub curated awesome lists)· Round-2 … Round-88

4629
唯一数据集(去重后)
4248
开放访问(open)
381
需申请 / 凭证(§11)
R88
加深轮次(R2–R88)

今晚做了什么

面向医学 LLM / 心血管方向,对公开可发现的数据集条目做通宵目录挖掘与归类: 从首轮合并约 68 条,经 Round-2 升至 264,通宵收尾至 4546, 再经 Round-88(GitHub curated) 升至 4629 条唯一条目 (开放 4248 · 门控 381)。

工作性质是编目与访问备注:按名称 / URL / Hugging Face id 去重,写入 master 章节并刷新统计。 未下载 PhysioNet / MIMIC 等原始临床数据;门控条目仅标注申请或凭证要求。

Round-88 列表净新增:101(开放 85 + 门控 16) 去重后唯一 Δ:+83(4546 → 4629) R88 前基线:4546 / 4181 / 365 峰值单轮净增:R85 143、R83 124、R79 111

Round-88 主要挖掘 GitHub awesome lists:Awesome-AI4Med、openmedlab/Awesome-Medical-Dataset、 geniusrise、Awesome-TCM-LLM、adnanmasood YAML 等。分类图使用「用途桶」计数; 开放总量 4248 不与用途桶相加(用途桶之间可重叠用途概念,且 §11 凭证类单独用甜甜圈展示访问结构)。

工作方法

  1. 连续 Round-N 加深:每轮按主题簇(多语执照考、药学、多模态、中文、心血管等)扩搜,记录净新增。
  2. 按名称 / URL / HF id 去重:同库镜像、别名、转载统一并入既有条目。
  3. 合并进 master 章节:写入用途分类与访问备注,同步刷新 stats.json 与进度日志。
  4. 0:00–8:00 每小时自检:核对累计唯一数、开放/门控拆分、当轮净增是否合理。
  5. 通宵收尾 + Round-88:晨间停机后继续 GitHub curated 加深,更新公开 HTML 报告与 Hugging Face Static Space。

结构一览

访问结构 · 开放 vs 门控

类型数量占比
开放(open)424891.8%
需申请 / 凭证(gated)3818.2%

4248 open · 381 gated · 合计 4629

用途分类(目的桶,不含 §11 双计)

类别数量
指令微调 / SFT / 对话1109
评测基准955
RAG / 知识库 / 指南566
多模态500
信息抽取 / NER / RE371
预训练语料336
中文医学专项182
摘要 / 生成89
偏好对齐 / DPO / RLHF88
心血管专科76

增长轨迹

Asia/Shanghai 夜班 → 早晨 → Round-88 · 里程碑为近似锚点;R80–R88 为合并基线精确值。

节点累计唯一
首轮合并~68
Round-2 后264
里程碑1000 → 1500 → 2000(~2030) → 2500 → 3000 → 4000
R80 前~3793
R81 → R883931 → 4002 → 4152 → 4247 → 4388 → 4469 → 4546 → 4629

后期轮次净新增(R68–R88)

轮次净新增轮次净新增
R6857R79111
R6981R8089
R7072R8180
R7181R8271
R7268(+并行 EchoBench)R83124
R7372R8495
R7469R85143
R7575R8687
R7678R8777
R7776R8883(列表 101)
R7880

关键时间线

首轮合并 ≈ 68
Round-2 后 → 264
里程碑:1000 → 1500 → 2000(~2030)→ 2500 → 3000 → 4000
R80 前 ≈ 3793 · R81→3931 · R82→4002 · R83→4152
R84→4247 · R85→4388 · R86→4469 · R87→4546
R88(GitHub curated)→ 4629(列表 +101 · 唯一 Δ +83)
公开 HTML / HF Static Space 同步更新至 4629

亮点簇(代表性,非穷尽)

多语执照 / 考试评测

INCLUDE Swedish / Belgian exams CNMLEQA MedXpertQA HealthBench 系列

药学 / 用药安全

NAPLEX DrugChat CDrugRed FAERS OpenPrescribing PharmGKB ChEMBL

多模态(图文 / 影像 / 生理信号)

Kvasir-VQA EchoVLM / EchoBench PMC-VQA HAM10000 / ISIC DeepLesion / fastMRI / MURA Chapman ECG VitalDB

目录条目含访问备注;未拉取 PhysioNet / MIMIC 原始临床文件。

中文医学专项

Huatuo 系列 CMB / CHIP PedMed-Bench TCM-Ladder AlphaMed19K CDrugRed

Round-88 · GitHub curated 示例

VitalDB OpenPrescribing PharmGKB ChEMBL UniProt HAM10000 / ISIC Chapman ECG AlphaMed19K TCM-Ladder DeepLesion / fastMRI / MURA gated: MIMIC-IV-ECHO gated: AmsterdamUMCdb gated: MedAlign gated: All of Us / UKB

来源列表含 Awesome-AI4Med、openmedlab/Awesome-Medical-Dataset、geniusrise、Awesome-TCM-LLM、adnanmasood YAML 等。

仍空 / 偏薄的硬缺口

以上缺口在 Round-88 后仍未改变,不影响 4629 总目录可用性;后续加深可优先补多语执照 MCQ、真实药师多轮剂量对话、中文病程开放文本。

产物路径

/workspace/medical-llm-datasets-master.md
主目录(章节合并后的唯一条目总表)
/workspace/medical-llm-datasets-stats.json
机器可读统计:total / open / gated / by_category
/workspace/medical-llm-datasets-progress.md
通宵进度与轮次日志
medical-llm-datasets-roundN-new.md
各轮净新增明细(R2–R88)
/workspace/medical-llm-datasets-overnight-report.html
本公开 HTML 报告(4629)
hf.co/spaces/fouier/medical-llm-datasets-overnight-report
Hugging Face Static Space 镜像